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ISSN: 2310-2799

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Año: 2025
ISSN: 2448-6698, 2007-1124
Vélez Labrada, José Luis; Pérez Rodríguez, Paulino; Nilforooshan, Mohammad Ali; Ruíz Flores, Agustin
Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
Machine Learning (ML) algorithms have proven advantageous in addressing challenges associated with the quantity and complexity of information, discovering patterns, performing efficient analyses, and serving as a decision-making tool. The objective of this study was to compare four ML methods —artificial neural networks (NN), regression trees (RT), random forests (RF), and support vector machines (SVM)— for predicting genomic value in European Swiss cattle using phenotypic records of birth weight (BW), weaning weight (WW) and yearling weight (YW), as well as genomic information. The results indicate that the predictive ability of the models varies according to the features and the amount of information available. NN, RF, and SVM exhibited similar performances, while RT underperformed. The SVM methodology stood out as the tool with the greatest potential, achieving the highest values of Pearson correlation between corrected phenotypes and predicted genetic values for WW. Despite its higher computational cost, the NN performed reasonably well, especially for BW and YW. The selection of the final model depends on the specific requirements of the application, as well as on such practical factors as data availability, computational resources, and interpretability; however, in general, the NN and SVM emerged as solid choices in several categories.
Año: 2025
ISSN: 2448-6698, 2007-1124
Nilforooshan, Mohammad Ali; Ruíz-Flores, Agustín; Pérez-Rodríguez, Paulino; Pabiou, Thierry; Saavedra-Jiménez, Luis Antonio; Valerio-Hernández, Jonathan Emanuel
Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
Actualmente, la evaluación genética de los rasgos de crecimiento (peso al nacer - PN, peso al destete - PD y peso al año - PA) en el ganado Braunvieh en México se lleva a cabo por medio de modelos univariados para el PN y bivariados para el PD y PA. La precisión de las evaluaciones genéticas se puede mejorar mediante un modelo trivariado. Se analizó tanto el sesgo en las evaluaciones univariadas y bivariadas causado por los rasgos faltantes en el análisis, como el aumento en la precisión producido por el análisis trivariado. Los datos de pedigrí y de rendimiento se obtuvieron de la Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Suizo de Registro. Después de editar los datos, se realizaron análisis univariados, bivariados y trivariados y se hicieron comparaciones entre ellos. Se empleó una estrategia simple de reducción del conjunto de datos, reduciendo notablemente la cantidad de datos en los análisis. Los animales excluidos de los análisis se evaluaron a partir de las soluciones de los animales incluidos en los análisis, lo cual requirió mucho menos poder de computación. El análisis bivariado mostró evaluaciones sesgadas del PD y PA y de las tendencias genéticas. Las tendencias genéticas se subestimaron en los animales jóvenes. Desde mediados de la década de 1990, todos los rasgos mostraron una ganancia genética constante. El sesgo se debió a la preselección natural/artificial para PN. La inclusión del PN en el análisis trivariado ayudó a tomar en cuenta la información de preselección. La evaluación univariada del PN y la tendencia genética fueron imparciales. También, el PN aumentó menos en precisión a partir del PD y PA que el PD y PA a partir del PN. Se recomienda el análisis trivariado de los rasgos con una reducción del conjunto de datos para reducir el poder computacional requerido para procesar los datos.
Año: 2025
ISSN: 2448-6698, 2007-1124
Ponce-Pérez, Oscar; Mendoza-Martínez , German David; Hernández-García , Pedro Abel; Gloria-Trujillo , Adrián; de la Torre-Hernández, María Eugenia; Lee-Rangel , Héctor Aaron; Flores-Ramírez , Rogelio; Roque-Jiménez , José Alejandro
Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
Los cambios en la producción de metano y dióxido de carbono y sus efectos sobre la microbiota ruminal se evaluaron in vitro mediante la incubación de alfalfa con un aditivo herbal formulado con Acacia concinna y con un suplemento que contenía el alga roja Palmaria palmata. Se caracterizaron los metabolitos del suplemento con Palmaria palmata y se encontraron 20 compuestos químicos, entre los que se destacaron fenoles, terpenos, compuestos halogenados y alcanos. La inclusión del aditivo herbal redujo (P<0.01) el metano ruminal en un 29 % y el alga roja en un 56 %. La concentración molar de ácidos grasos volátiles (AGV) aumentó (P<0.05) con el aditivo de algas marinas. Los dos aditivos aumentaron las proporciones de acetato y propionato y redujeron la de butirato (P<0.05) en comparación con el control. No se detectaron diferencias (P>0.05) en la abundancia de la mayoría de las familias microbianas, solo cambios menores en Rikenellaceae; únicamente Cellulomonadaceae aumentó significativamente (P>0.001) con el aditivo herbal. Los dos aditivos mostraron un potencial reductor de metano, que fue más pronunciado para Palmaria palmata.
Año: 2025
ISSN: 2448-6698, 2007-1124
Basurto Gutiérrez, Ricardo; Ramírez Rodríguez, Ericka; Mariscal Landín, Gerardo
Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
This study aimed to use near-infrared reflectance spectroscopy (NIRS) to estimate the chemical composition of ingredients for pigs. Samples (n=118) of grains (corn and sorghum) and meals (soybeans and rapeseed) were collected. Samples were analyzed for dry matter (DM), organic matter (OM), crude protein (CP), ethereal extract (EE), neutral detergent fiber (NDF) or acid detergent fiber (ADF), total starch (starch), and gross energy (GE), and were scanned with an FTIR spectrophotometer. This information was used to develop calibration equations (CES) by employing a program package (TQ Analyst; Thermo Fisher Scientific). The selection of the CE was based on the minimization of standard errors of calibration (SEC), cross-validation (SECV) and prediction (SEP), and the maximization of determination coefficients of calibration (R2cal) and validation (R2val). The predictive power of the CE was assessed using the RPD (ratio of prediction to deviation) statistic. Except for DM, the statistics for OM (0.99, 0.21, 0.39, 0.999, 0.34, and 7.3), CP (0.99, 0.62, 0.95, 0.998, 0.99, and 28.2), EE (0.98, 0.15, 0.31, 0.963, 0.22, and 3.7), NDF (0.98, 0.60, 1.82, 0.962, 1.38, and 3.6), ADF (0.99, 0.70, 1.43, 0.979, 1.04, and 4.6), starch (0.99, 2.31, 3.34, 0.994, 3.03, and 9.7), and GE (0.98, 22.8, 34.9, 0.976, 36.0, and 4.2), R2cal, SEC, SECV, R2val, SEP, and RPD, respectively, support the conclusion that CES have an acceptable predictive capacity of the chemical composition of pig feed ingredients.
Año: 2025
ISSN: 2448-6698, 2007-1124
Ortega-Portilla, Paola Andrea; Escobar-Chavarría, Omar; Gutiérrez-Pabello, José Ángel
Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
Una de las características distintivas de la infección por Mycobacterium bovis es la muerte celular. El tipo de muerte celular que se produce durante la infección determina la persistencia de las enfermedades micobacterianas. El objetivo de este artículo es proporcionar una revisión integral y trazar los posibles escenarios de los tipos de muerte celular en la patogénesis de la tuberculosis bovina. Con los datos actuales se puede concluir que: 1) el desarrollo de la apoptosis y sus diferentes variantes está relacionado con el control de micobacterias, 2) la autofagia es un mecanismo conservado que limita la replicación intracelular de micobacterias, 3) la piroptosis es un mecanismo extremo que ayuda a controlar M. bovis a costa de dañar el tejido del hospedero, y 4) la necrosis permitirá el escape y proliferación de micobacterias.
Año: 2025
ISSN: 2448-6698, 2007-1124
Monge-Navarro, Francisco Javier; Gaxiola Camacho, Soila Maribel; López Valencia, Gilberto; Trasviña Muñoz, Enrique; Castro Del Campo, Nohemí; Herrera Ramírez, José Carloman
Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
En México, son escasos los estudios sobre el coronavirus respiratorio bovino (BCoV) en ganado de engorda. Hasta la fecha, el BCoV solo se ha reportado en operaciones de engorda en el noroeste del país. Se realizó un estudio epidemiológico-molecular en ganado de engorda estabulado para establecer la prevalencia de BCoV y actualizar la información disponible sobre su presencia en la región noroeste de México. Empleando una técnica de reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real cuantitativa (qRT-PCR) dirigida a un fragmento del gen que codifica para la proteína espiga de BCoV, se analizaron 154 muestras de ARN de exudado nasal colectadas de animales asintomáticos (n=100) y enfermos (n=54). Del total de las muestras, 95 resultaron positivas, para una prevalencia general de 61.7 % y un promedio de 1 x 105 partículas virales/ml de exudado nasal. De las muestras positivas, 33 (21.4 %) pertenecían al grupo de animales enfermos, y 62 (40.3 %) al grupo de animales asintomáticos. La prevalencia del BCoV establecida en este trabajo representa un aumento de 23.7 puntos porcentuales con respecto al 38.0 % de prevalencia reportado previamente en los mismos corrales de engorda. Lo anterior, hace evidente la necesidad de implementar programas de vacunación que confieran protección contra el BCoV y ayuden a controlar su expansión en el ganado de engorda en la región. Se requiere de más estudios eco-epidemiológicos para identificar las posibles causas que favorecen la rápida propagación de este virus entre el ganado de engorda del noroeste de México.
Año: 2025
ISSN: 2448-6698, 2007-1124
Lozano-Domínguez, Renato Raúl; Arechiga-Flores, Carlos Fernando; Cortés-Vidauri, Zimri; Rincón-Delgado, Melba; Rochín-Berumen, Fabiola; Mejía-Haro, Ignacio
Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
The objective was to determine the social, agricultural-livestock, and productive characteristics of the family dairy system of Aguascalientes. A total of 180 milk production family units were visited randomly. The sample size was a finite population of production units with dairy activity (99 % confidence level). Social, agricultural-livestock, and productive aspects were recorded through a survey. Ejido property (65 %) predominates over small property (34.5 %). Family labor represents 89.1 %, and the average age of the producer is 49.6 yr, where 20.6 % of them are under 50 (P<0.01). Fifty-five percent of the producers attended only elementary school (P<0.01). The sale of milk is the only source of income of the production units (92.8 %), and they are not self-sufficient in forage production (79.2 %). The total number of hectares on the small property (12.4 ± 1.1) was higher than the ejido system (8.4 ± 1.2) (P<0.05). The main crops were corn, in irrigated (55.0 %) and rainfed areas (51.1 %), and alfalfa (48.3 %). The predominant breed was Holstein (91 %). Milking was mechanical (75.5 %). Milk production per cow in the ejido system was higher than that of the small-property system (17.6 vs. 14.5 L/d; P<0.05). Family labor contributes to the viability of the family dairy production system. Nevertheless, the low adoption of technology and the insufficiency of cultivation areas to produce forage in quantity and quality limit the productivity of the system.
Año: 2025
ISSN: 2448-6698, 2007-1124
Villela Velarde, Jorge Luis; Quintana Dolores, Paola Giovanna María; Velarde Marcos, María Lourdes; Vargas Rodriguez, Teresa; Gonzales Lecaros, Rosario; Dextre Chacón, José
Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
Hasta la fecha no se han determinado los parámetros genéticos de sobrealcance, término y agudez en Caballos Peruanos de Paso (CPP). Es importante estimar estos parámetros para su aplicación en la crianza de CPP, por lo tanto, el objetivo de este estudio fue estimar la heredabilidad, repetibilidad y correlaciones genéticas en condiciones de campo del sobrealcance, término y agudez de CPP. El estudio incluyó 134, 137 y 134 registros de sementales y yeguas para los rasgos de sobrealcance, término y agudez, respectivamente. Todas las mediciones se grabaron en formato de vídeo MP4 con una resolución de 1,920 x 1,080 megapíxeles y a 60 fotogramas por segundo. Todos los rasgos se midieron de tres a cinco veces (una vez por zancada) y se analizó cada rasgo. Para el análisis de las mediciones se utilizó el software KINOVEA versión 0.9.5. Se utilizó un modelo animal multivariado de medidas repetidas con efecto del sexo para estimar los componentes de la varianza para cada rasgo utilizando el software WOMBAT. Los resultados mostraron una heredabilidad de 0.411, 0.476 y 0.405, para los rasgos de sobrealcance, término y agudez, respectivamente. La repetibilidad fue alta en todos los rasgos (> 0.70). Las correlaciones genéticas aditivas oscilaron entre -0.30 y 0.49. Se puede concluir que el sobrealcance y el término tienen altos valores de heredabilidad, lo que permite que estos rasgos respondan mejor en un proceso de selección, a diferencia de la agudez, que tiene un valor de heredabilidad moderado.
Año: 2025
ISSN: 2448-6698, 2007-1124
De La Cruz Colín, Lino; F. Walkom, Samuel; Swan, Andrew A.
Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
El objetivo de este estudio fue estimar los parámetros genéticos de rasgos de peso de ovinos Pelibuey. Los rasgos analizados fueron peso al nacer (PN), peso al destete (PD), peso a los 120 días (P120), peso a los 150 días (P150), y peso a los 210 días (P210). Se utilizó un conjunto de datos con registros de 51,382 corderos, progenie de 1,440 sementales y 14,715 madres para realizar análisis genéticos, utilizando un modelo animal. Se ajustaron seis modelos que variaban los efectos aleatorios, incluidos los efectos genéticos, maternos y ambientales permanentes maternos. Luego, los mismos modelos base se ajustaron con el efecto aleatorio adicional de la interacción semental por rebaño. Las estimaciones de heredabilidad directa para los modelos base oscilaron entre 0.13 y 0.18 y se redujeron en todos los rasgos cuando la interacción semental por rebaño se ajustó en el modelo (0.03 a 0.11). Las correlaciones genéticas aditivas variaron de 0.49 a 0.96 y de 0.81 a 1.00 para los modelos base y los modelos de semental por rebaño, respectivamente. Se realizaron análisis de validación para estudiar la predictibilidad de los VGE de los sementales en el rendimiento de la progenie, con un procedimiento de validación cruzada desarrollado para P120. El ajuste de semental por rebaño mejoró la predictibilidad, con valores de 0.22 para todos los sementales, y de 0.43 para los sementales de enlace, cerca del valor esperado de 0.50. Las tendencias genéticas anuales estimadas fueron 0.011, 0.051, 0.060, 0.068 y 0.045 kg/año para PN, PD, P120, P150 y P210, respectivamente, para el período comprendido entre 2010 y 2017. En general, los resultados indican que es posible realizar una evaluación genética entre rebaños para ovinos Pelibuey en México.
Año: 2025
ISSN: 2448-6698, 2007-1124
Callejas Juárez, Nicolás; Domínguez Arrieta, Eduardo; Guzmán Soria, Eugenio; Rodriguez Licea, Gabriela
Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
El análisis de redes sociales (ARS) ofrece una forma alternativa de estudiar el mercado de ganado destinado al sacrificio, permitiendo realizar mediciones con el fin de analizar tanto el origen como el destino de dichos animales. La investigación aquí descrita se propuso determinar la estructura de red del mercado interno de ganado movilizado para el sacrificio en México entre 2017 y 2021. La estructura de ese mercado se analizó utilizando medidas de localización espacial, especialización económica, de densidad de la red y especialización. Un promedio de 4.7 millones de cabezas de ganado fueron movilizadas cada año en México para su sacrificio, con 302 permisos de movilización solicitados cada día, cada uno para un promedio de 42.7 cabezas de ganado. La especialización relativa del mercado fue baja, siendo mayor para la demanda, pero no diferente de la oferta (P>0.05). El mercado se caracterizó por el comercio intraestatal, la baja densidad de la red, la baja centralidad de los insumos, la baja centralidad de los productos y los altos niveles de especialización del mercado municipal. De ahí que el mercado nacional de ganado para sacrificio tenga baja especialización, alta diversificación y homofilia.

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