A revista Paubrasilia publica trabalhos científicos originais em todas as áreas da botânica, bem como em áreas correlatas, desde que evidenciem os aspectos botânicos. Áreas temáticas que se enquadram no escopo da revista incluem acervos e coleções botânicas, biogeografia vegetal, biologia reprodutiva de plantas, biotecnologia vegetal, botânica econômica, botânica estrutural, conservação vegetal, divulgação científica em botânica, ecologia vegetal, educação ambiental voltada à botânica, ensino de botânica, etnobotânica, ficologia, fisiologia vegetal, jardins botânicos, micologia, palinologia, paleobotânica e sistemática vegetal. Adicionalmente, o corpo editorial pode aceitar notas, registros de ocorrência, checklists, revisões bibliográficas e relatos afins ao escopo do periódico. Paubrasilia é uma publicação eletrônica revisada por pares, gratuita, editada pelo Jardim Botânico FLORAS na Universidade Federal do Sul da Bahia, Brasil. Desde 2021, a revista adota o sistema de publicação contínua de artigos, dando maior celeridade ao processo de publicação.
Paubrasilia publishes original scientific papers in all areas of botany, as well as in related areas, as long as they have botanical aspects. Thematic areas that fit into the scope of the journal include botanical collections and archives, plant biogeography, plant reproductive biology, plant biotechnology, economic botany, structural botany, plant conservation, scientific dissemination in botany, plant ecology, environmental education focused on botany, teaching of botany, ethnobotany, phycology, plant physiology, botanical gardens, mycology, palynology, paleobotany, and plant systematics. Additionally, the editorial board can accept notes, records, checklists, bibliographic reviews, and reports related to the journal's scope. Paubrasilia is a peer-reviewed electronic publication, free of charge, edited by the FLORAS Botanical Garden at the Southern Bahia Federal University, Brazil. Since 2021, the journal has adopted the Continuous Article Publishing system, which helps speed up the publication process.